More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3436 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  90.09 
 
 		 253 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  71.43 
 
 		 254 aa  337  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  68.83 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  68.85 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  71.43 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  69.4 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  65.95 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  66.81 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  63.37 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  62.96 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  64.9 
 
 		 241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  65.69 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  60.94 
 
 		 236 aa  305  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  64.22 
 
 		 235 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  62.34 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  60.5 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  60 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  61.9 
 
 		 234 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  63.56 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  62.07 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  64.38 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  61.47 
 
 		 244 aa  294  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  62.34 
 
 		 234 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 235 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  64.5 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  60.78 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  64.35 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  66.67 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  60.17 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  60.17 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  65.32 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.89 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 233 aa  255  6e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  56 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.78 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  54.11 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  52.91 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  52.79 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.63 
 
 		 233 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  51.72 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  48.93 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.98 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  51.54 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.65 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  52.23 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.33 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  50.22 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  47.98 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.33 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.78 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.67 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.88 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.64 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.93 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  49.11 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.74 
 
 		 604 aa  201  9.999999999999999e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.89 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.3 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.67 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.64 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.5 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.48 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.13 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.73 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  45.33 
 
 		 293 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.98 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  47.2 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.3 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  49.06 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.54 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  46.64 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.85 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>