More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1715 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1715  ATPase  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  66.53 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  56.03 
 
 		 251 aa  284  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  59.05 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.42 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  56 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  54.66 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  53.22 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  53.07 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  54.55 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.11 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  53.48 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  56.44 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  52.81 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  51.95 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  56.44 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  55.93 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.08 
 
 		 234 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  54.04 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  56 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  55.84 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  55.16 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  53.02 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 245 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  53.68 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  52.61 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  53.02 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.71 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  50.86 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  56.42 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  52.81 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  55.05 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  55.05 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  51.69 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  49.35 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  52.89 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  50.64 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  51.32 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.61 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  51.56 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  54.67 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  52.44 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  51.11 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  52 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  51.72 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.69 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.02 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.66 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.25 
 
 		 604 aa  211  9e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 345 aa  207  9e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.25 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.67 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.67 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.78 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  46.75 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.8 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 286 aa  191  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 319 aa  191  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  49.07 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.73 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  43.48 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.03 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  45.66 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  46.75 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  45.27 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  41.96 
 
 		 249 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.69 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.05 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  46.3 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.29 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  44.96 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  40.17 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.23 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>