More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1056 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  75.97 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  68.51 
 
 		 236 aa  314  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  66.23 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  66.23 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  64.58 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  67.09 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  66.38 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.1 
 
 		 238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  62.66 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  63.79 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  65.52 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.4 
 
 		 253 aa  297  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  64.53 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  62.39 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  65.81 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.38 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  66.24 
 
 		 243 aa  294  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  61.32 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  62.03 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  61.92 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  62.07 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  64.81 
 
 		 248 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  64.38 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  64.38 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.23 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  62.13 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  63.25 
 
 		 236 aa  285  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  65.37 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  63.27 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  59.29 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  59.91 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  64.19 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  54.31 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.83 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  53.07 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.45 
 
 		 236 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  50.88 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  50.89 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.72 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.75 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  49.12 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  49.12 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  48.02 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  47.37 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.37 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  49.12 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.68 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.88 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.41 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  53.55 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  44.83 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  49.34 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.82 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.72 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.08 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.22 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.56 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.09 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.13 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  51.89 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.17 
 
 		 288 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 302 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.09 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.69 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.58 
 
 		 264 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.39 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  42.29 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  46.75 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  47.5 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.08 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.74 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.04 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.74 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.85 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  43.24 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>