More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4268 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  75.74 
 
 		 240 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  74.68 
 
 		 243 aa  352  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  74.25 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  70.34 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  68.24 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  70.04 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  68.83 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  67.83 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  67.66 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.71 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  67.39 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  64.94 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  67.39 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  62.98 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  64.1 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  64.38 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  65.25 
 
 		 235 aa  301  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  62.77 
 
 		 234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  63.36 
 
 		 251 aa  297  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  66.23 
 
 		 245 aa  297  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  63.87 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  66.39 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  62.77 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  61.9 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  63.4 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  62.93 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  61.3 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  65.8 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  60.87 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  65.37 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  60.85 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  63.68 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.36 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.16 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.31 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  52.42 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  50.86 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.3 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  50.89 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.98 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.56 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.12 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.02 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  48.02 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  46.72 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  46.96 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  47.19 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  46.7 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.83 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.78 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  49.78 
 
 		 243 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  50.7 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.88 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.25 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  50.7 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  40.6 
 
 		 604 aa  207  9e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 345 aa  207  9e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  49.54 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.7 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  48.02 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.27 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  52.38 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.84 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.18 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.71 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.49 
 
 		 293 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.16 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.05 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  41.63 
 
 		 300 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  46.05 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.54 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.79 
 
 		 280 aa  194  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.61 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>