More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4473 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  100 
 
 		 291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  72.02 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  67.5 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  67.95 
 
 		 256 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  67.09 
 
 		 455 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.27 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  63.4 
 
 		 256 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  65.5 
 
 		 255 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.98 
 
 		 250 aa  318  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  63.93 
 
 		 264 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  64.63 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  63.03 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  62.16 
 
 		 277 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  65.25 
 
 		 255 aa  314  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  66.38 
 
 		 445 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.92 
 
 		 258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  64.41 
 
 		 258 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  62.28 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.54 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.26 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  60.42 
 
 		 258 aa  299  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.61 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.34 
 
 		 259 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  61.8 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.04 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 255 aa  291  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 302 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  60.53 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  57.31 
 
 		 252 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.57 
 
 		 244 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 271 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  64.52 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  64.1 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 247 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 279 aa  281  8.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  56.42 
 
 		 268 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.3 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.33 
 
 		 274 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.46 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.51 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.87 
 
 		 255 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  56.58 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  51.72 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  57.76 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  56.14 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  53.25 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.46 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 266 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.01 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.07 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.7 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  56.62 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.23 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 243 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  54.11 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.41 
 
 		 249 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 227 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.94 
 
 		 225 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  47.44 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  52.68 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.5 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.53 
 
 		 225 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  45.25 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.4 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.73 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  50.22 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.61 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 247 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 229 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  47.14 
 
 		 253 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.03 
 
 		 653 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  45.53 
 
 		 241 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.95 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  47.14 
 
 		 253 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.37 
 
 		 223 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.46 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.91 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45 
 
 		 238 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  43.04 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 250 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  46.08 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>