More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03250 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.84 
 
 
236 aa  247  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  50.43 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  48.9 
 
 
232 aa  238  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  48.68 
 
 
244 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 
244 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  46.96 
 
 
232 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  45.49 
 
 
233 aa  229  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  48.43 
 
 
254 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 
248 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
233 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
233 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  44.78 
 
 
234 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  47.56 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  43.04 
 
 
234 aa  224  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.66 
 
 
230 aa  222  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  45.98 
 
 
236 aa  221  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  47.81 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  43.26 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  44.64 
 
 
233 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.61 
 
 
233 aa  216  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
245 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  47.47 
 
 
240 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  43.91 
 
 
245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  42.49 
 
 
233 aa  214  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  46.02 
 
 
235 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  42.49 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  46.85 
 
 
226 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  45.26 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  44.64 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  47.3 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  45.29 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
233 aa  211  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
244 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
253 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
345 aa  209  3e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  45.95 
 
 
245 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  47.47 
 
 
236 aa  208  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  45.65 
 
 
235 aa  207  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  45.61 
 
 
234 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  43.42 
 
 
251 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  43.48 
 
 
243 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  45.61 
 
 
234 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.45 
 
 
223 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  46.67 
 
 
241 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  42.11 
 
 
244 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  42.11 
 
 
233 aa  205  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 
244 aa  204  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
221 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.73 
 
 
229 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  43.42 
 
 
248 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  42.54 
 
 
253 aa  202  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  42.67 
 
 
245 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
235 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  42.67 
 
 
236 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.2 
 
 
233 aa  201  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  44.8 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  45.62 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  41.99 
 
 
233 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  45.07 
 
 
243 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.67 
 
 
604 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.7 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  45.54 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
233 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.99 
 
 
227 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  43.69 
 
 
238 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
233 aa  192  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
227 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
235 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.92 
 
 
225 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
232 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  42.01 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  43.75 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  44.35 
 
 
258 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  48.76 
 
 
235 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.5 
 
 
237 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
291 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.33 
 
 
233 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  46.77 
 
 
228 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
234 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  44.54 
 
 
234 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
229 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.91 
 
 
225 aa  184  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.24 
 
 
239 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
233 aa  184  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.58 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  44.75 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
255 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 
240 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  45.41 
 
 
256 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  40.69 
 
 
715 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>