More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3459 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.56 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.68 
 
 
230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
246 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.66 
 
 
234 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
248 aa  211  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50.67 
 
 
230 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  47.27 
 
 
221 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
236 aa  208  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
229 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  46.9 
 
 
251 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.17 
 
 
241 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50 
 
 
253 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.56 
 
 
253 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.7 
 
 
260 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.75 
 
 
253 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.41 
 
 
230 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  48.64 
 
 
228 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
228 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
228 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
232 aa  201  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.64 
 
 
224 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.57 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  49.55 
 
 
228 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.35 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.22 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  49.33 
 
 
655 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 
228 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.43 
 
 
240 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
221 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
233 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  48.44 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  48.05 
 
 
707 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.44 
 
 
235 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.44 
 
 
229 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.87 
 
 
242 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.85 
 
 
236 aa  198  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
224 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
224 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
224 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.58 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  47.71 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.21 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  42.99 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.25 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.21 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.53 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  45.56 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  46.85 
 
 
715 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.81 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.05 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.23 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  44.87 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.99 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.53 
 
 
227 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.37 
 
 
236 aa  194  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.61 
 
 
232 aa  194  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
224 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45.54 
 
 
254 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.58 
 
 
233 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.11 
 
 
227 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.58 
 
 
277 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  45.57 
 
 
230 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 
237 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.05 
 
 
242 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.7 
 
 
259 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
222 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.19 
 
 
240 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
224 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  47.37 
 
 
233 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.44 
 
 
240 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.54 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  43.11 
 
 
256 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  42.08 
 
 
234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.88 
 
 
229 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
241 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
252 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  44.93 
 
 
235 aa  192  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.34 
 
 
224 aa  192  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.55 
 
 
237 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  43.44 
 
 
235 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
236 aa  192  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  52.26 
 
 
236 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.7 
 
 
226 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
240 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
235 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.74 
 
 
231 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  47.58 
 
 
225 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>