More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01135 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  78.54 
 
 
233 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  61.01 
 
 
219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  57.53 
 
 
254 aa  276  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  57.21 
 
 
233 aa  268  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  53.6 
 
 
226 aa  249  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  52.68 
 
 
237 aa  247  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.88 
 
 
239 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.25 
 
 
236 aa  245  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
233 aa  244  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.23 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.16 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  51.13 
 
 
232 aa  242  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  53.1 
 
 
246 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 
226 aa  241  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  241  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 
226 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  50.68 
 
 
239 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  53.33 
 
 
248 aa  241  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 
224 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  52.47 
 
 
224 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.89 
 
 
226 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.47 
 
 
247 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
228 aa  238  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.13 
 
 
260 aa  238  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.34 
 
 
242 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.55 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 
224 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
229 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  51.58 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.65 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.92 
 
 
258 aa  233  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.32 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.66 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.61 
 
 
226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
238 aa  230  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  50.22 
 
 
248 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.66 
 
 
225 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  49.11 
 
 
256 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  48.18 
 
 
221 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.44 
 
 
233 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.35 
 
 
244 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
253 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  51.57 
 
 
250 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
236 aa  228  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.98 
 
 
253 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  46.78 
 
 
643 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.43 
 
 
241 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  48.26 
 
 
232 aa  228  7e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  46.4 
 
 
240 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
241 aa  227  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
233 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.32 
 
 
238 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.9 
 
 
241 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.32 
 
 
230 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.51 
 
 
228 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  48.65 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  48.2 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
238 aa  224  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.85 
 
 
229 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.21 
 
 
230 aa  224  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.46 
 
 
230 aa  224  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.2 
 
 
229 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.48 
 
 
249 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  48.21 
 
 
252 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  48.46 
 
 
248 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.88 
 
 
266 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50.49 
 
 
236 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.25 
 
 
240 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  50.88 
 
 
235 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
228 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  222  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  47.79 
 
 
251 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  45.54 
 
 
657 aa  221  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.71 
 
 
228 aa  221  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.88 
 
 
225 aa  221  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  50.24 
 
 
211 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  45.74 
 
 
657 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>