More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1893 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  66.36 
 
 
224 aa  290  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  68.64 
 
 
225 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  51.79 
 
 
233 aa  234  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  53.64 
 
 
239 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
246 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.58 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.36 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48 
 
 
230 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.87 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.4 
 
 
226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48 
 
 
230 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  52.04 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.77 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
250 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.32 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.21 
 
 
247 aa  218  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.32 
 
 
231 aa  218  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  48 
 
 
228 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.96 
 
 
242 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.4 
 
 
228 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
643 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  51.8 
 
 
234 aa  215  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  50.67 
 
 
243 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.23 
 
 
291 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.22 
 
 
260 aa  215  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.45 
 
 
254 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  51.58 
 
 
254 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.3 
 
 
239 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.32 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  47.11 
 
 
654 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  49.33 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.67 
 
 
241 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.95 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  46.61 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47.11 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.07 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.18 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.77 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.8 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.96 
 
 
239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.65 
 
 
286 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.86 
 
 
249 aa  210  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.95 
 
 
266 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.64 
 
 
224 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
240 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
224 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 
227 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
222 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.91 
 
 
259 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 
658 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 
253 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.17 
 
 
248 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  47.03 
 
 
241 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.17 
 
 
248 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.51 
 
 
225 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.58 
 
 
253 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  52.04 
 
 
715 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
224 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
240 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47.03 
 
 
241 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
224 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
224 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  49.55 
 
 
230 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.27 
 
 
235 aa  207  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
228 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
220 aa  207  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.51 
 
 
252 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  44.34 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  49.77 
 
 
256 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  50.91 
 
 
252 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.98 
 
 
226 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  48 
 
 
243 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.06 
 
 
229 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
238 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  48 
 
 
235 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  48.18 
 
 
233 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  46.22 
 
 
228 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
224 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.43 
 
 
241 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  48.2 
 
 
264 aa  206  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
255 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  51.6 
 
 
236 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 
232 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.21 
 
 
223 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
221 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  51.57 
 
 
258 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  46.19 
 
 
244 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  48.4 
 
 
228 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>