More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4676 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.84 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  54.31 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  54.31 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  53.68 
 
 		 236 aa  261  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  53.68 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  52.38 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  52.02 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.02 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  53.25 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  251  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  52.81 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  51.3 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50.86 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  51.3 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  51.95 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  53.78 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  51.75 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  51.56 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.95 
 
 		 233 aa  246  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  51.33 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.68 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  52.91 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  51.56 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  51.72 
 
 		 248 aa  241  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  51.12 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  50.65 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  51.95 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  51.11 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  51.95 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.92 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  52.47 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  50.86 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  51.29 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  49.78 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  49.34 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  51.98 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  46.32 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  48.02 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  48.02 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 345 aa  227  1e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.62 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  44.44 
 
 		 604 aa  225  4e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  45.69 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.29 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  44.54 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.08 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 319 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.5 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  46.36 
 
 		 232 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.48 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.67 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.4 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.89 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.29 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  39.66 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.05 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  42.34 
 
 		 715 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  45.05 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.29 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.74 
 
 		 300 aa  190  1e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.04 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.66 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  42.73 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.48 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.62 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.48 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  44.75 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  41.18 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.91 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>