More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0216 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  67.39 
 
 
241 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  64.78 
 
 
244 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.64 
 
 
253 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  59.83 
 
 
248 aa  305  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 
245 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  62.93 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  59.4 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  63.04 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  60.59 
 
 
235 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  59.83 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  60.34 
 
 
251 aa  298  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  61.4 
 
 
248 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  59.05 
 
 
244 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  61.84 
 
 
251 aa  295  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  57.51 
 
 
238 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  59.75 
 
 
236 aa  291  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  58.7 
 
 
254 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  58.33 
 
 
244 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  58.19 
 
 
238 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  59.91 
 
 
235 aa  288  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  59.05 
 
 
253 aa  288  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  59.23 
 
 
240 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  60.17 
 
 
236 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  59.91 
 
 
240 aa  286  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  61.3 
 
 
238 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  59.13 
 
 
245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  59.05 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  57.27 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  55.26 
 
 
234 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  59.31 
 
 
241 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  60.61 
 
 
250 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.6 
 
 
239 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  55.26 
 
 
236 aa  269  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.07 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  54.35 
 
 
234 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  54.35 
 
 
234 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  53.48 
 
 
234 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  53.91 
 
 
245 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  50.86 
 
 
233 aa  250  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  52.54 
 
 
236 aa  250  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  52.59 
 
 
233 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  52.16 
 
 
234 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.29 
 
 
233 aa  248  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  53.51 
 
 
233 aa  247  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  53.1 
 
 
233 aa  246  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  51.75 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  51.77 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.29 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.47 
 
 
236 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  50.88 
 
 
233 aa  238  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
233 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  49.78 
 
 
234 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  48.67 
 
 
233 aa  235  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.65 
 
 
235 aa  232  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.61 
 
 
232 aa  221  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  45.61 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
233 aa  214  9e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.78 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  46.49 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.42 
 
 
604 aa  210  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  45.11 
 
 
243 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  43.72 
 
 
300 aa  206  3e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.45 
 
 
233 aa  205  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
286 aa  201  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.69 
 
 
237 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.04 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  45.29 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.74 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.16 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.29 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.84 
 
 
234 aa  194  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  45.09 
 
 
228 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.95 
 
 
235 aa  191  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  44.55 
 
 
258 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.8 
 
 
241 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  41.85 
 
 
230 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
225 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.93 
 
 
225 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.93 
 
 
225 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.1 
 
 
238 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.37 
 
 
228 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 
248 aa  188  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
220 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.22 
 
 
230 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  46.82 
 
 
298 aa  188  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.19 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.5 
 
 
244 aa  187  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
255 aa  187  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  43.24 
 
 
228 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  43.89 
 
 
253 aa  187  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  45.63 
 
 
230 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
224 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
262 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  43.66 
 
 
259 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>