More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1576 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  75 
 
 
236 aa  348  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  75.11 
 
 
240 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  70.82 
 
 
244 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  69.4 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  67.38 
 
 
251 aa  314  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  66.52 
 
 
235 aa  304  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  68.86 
 
 
235 aa  304  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  68.09 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  63.48 
 
 
245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  67.24 
 
 
244 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  67.24 
 
 
248 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  63.09 
 
 
235 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  63.83 
 
 
241 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  67.24 
 
 
244 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  65.37 
 
 
238 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  66.38 
 
 
240 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  64.94 
 
 
254 aa  295  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.22 
 
 
238 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  60.17 
 
 
236 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  63.25 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  65.8 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  59.48 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.36 
 
 
253 aa  280  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  65.96 
 
 
250 aa  279  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 
234 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  60 
 
 
248 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  63.11 
 
 
245 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  61.37 
 
 
234 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  59.91 
 
 
244 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  60.78 
 
 
243 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  61.37 
 
 
234 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  54.51 
 
 
239 aa  267  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  59.48 
 
 
253 aa  266  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  60.44 
 
 
251 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  63.89 
 
 
234 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  55.51 
 
 
236 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  53.78 
 
 
233 aa  263  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  52.38 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  52.04 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.78 
 
 
234 aa  251  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 
233 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 
233 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
235 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  52.89 
 
 
233 aa  248  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.33 
 
 
233 aa  247  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.69 
 
 
236 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  50.64 
 
 
234 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  50.45 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  49.55 
 
 
233 aa  241  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.44 
 
 
233 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 
233 aa  236  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.14 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  50.42 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  46.26 
 
 
232 aa  232  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  47.14 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
345 aa  229  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  43.48 
 
 
604 aa  228  7e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.7 
 
 
234 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
233 aa  223  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.11 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 
240 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.35 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.66 
 
 
235 aa  210  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  43.17 
 
 
232 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.47 
 
 
233 aa  208  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.29 
 
 
223 aa  207  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.89 
 
 
230 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.25 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 
253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.52 
 
 
644 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  43.86 
 
 
300 aa  206  4e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.26 
 
 
253 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.7 
 
 
234 aa  205  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 
246 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.25 
 
 
234 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  54.72 
 
 
268 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.95 
 
 
226 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.85 
 
 
252 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.88 
 
 
237 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.68 
 
 
236 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 
232 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.23 
 
 
239 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.05 
 
 
235 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.6 
 
 
229 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
228 aa  202  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.91 
 
 
319 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.43 
 
 
234 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  47.03 
 
 
329 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.84 
 
 
234 aa  201  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.18 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.81 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.24 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.09 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
228 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  45.73 
 
 
661 aa  198  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  47.53 
 
 
234 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>