More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1081 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  66.09 
 
 
233 aa  322  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  65.24 
 
 
233 aa  322  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  59.48 
 
 
234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  60.94 
 
 
233 aa  301  6.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  61.8 
 
 
233 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  60.52 
 
 
233 aa  298  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  60.52 
 
 
233 aa  298  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  57.08 
 
 
233 aa  298  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  57.51 
 
 
233 aa  294  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  55.36 
 
 
233 aa  291  9e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  57.58 
 
 
234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  57.94 
 
 
233 aa  280  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.94 
 
 
233 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  56.9 
 
 
234 aa  279  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
233 aa  269  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  55.84 
 
 
236 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.54 
 
 
236 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  50.21 
 
 
244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 
238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  51.5 
 
 
233 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  52.17 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 
248 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  52.54 
 
 
236 aa  250  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
245 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.42 
 
 
239 aa  248  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
244 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  51.29 
 
 
244 aa  247  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  49.78 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  50.45 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  48.94 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 
240 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  49.57 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  50.43 
 
 
248 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
234 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  49.35 
 
 
232 aa  239  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 
253 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.95 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  50.45 
 
 
251 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  48.88 
 
 
245 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  50.88 
 
 
240 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  236  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  48.26 
 
 
253 aa  235  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  46.98 
 
 
238 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  49.57 
 
 
241 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.67 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  45.61 
 
 
234 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  45.61 
 
 
234 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  49.57 
 
 
245 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 
235 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  50.22 
 
 
241 aa  228  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.66 
 
 
236 aa  228  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
235 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  45.96 
 
 
238 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.45 
 
 
232 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  46.75 
 
 
232 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
345 aa  223  3e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.98 
 
 
233 aa  221  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  49.78 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  45.92 
 
 
243 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.53 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  44.92 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  43.83 
 
 
604 aa  211  5.999999999999999e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.61 
 
 
230 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.99 
 
 
226 aa  198  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.66 
 
 
225 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  42.72 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.85 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.85 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
643 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  43.46 
 
 
300 aa  193  2e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
229 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
220 aa  192  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.46 
 
 
234 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.67 
 
 
234 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.02 
 
 
234 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.32 
 
 
246 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  43.06 
 
 
247 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.79 
 
 
293 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.64 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.61 
 
 
244 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.16 
 
 
235 aa  188  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.05 
 
 
234 aa  188  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.05 
 
 
234 aa  188  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.38 
 
 
225 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.17 
 
 
230 aa  187  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.86 
 
 
231 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
229 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  42.59 
 
 
246 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
286 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
221 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 
235 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  47.53 
 
 
225 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  43.54 
 
 
256 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>