More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1363 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  64.96 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  61.64 
 
 		 233 aa  304  7e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  61.64 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  62.5 
 
 		 233 aa  298  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  61.21 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 		 233 aa  297  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.48 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  58.62 
 
 		 233 aa  290  9e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  57.33 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  58.97 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  57.76 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  55.17 
 
 		 233 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  56.9 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  51.95 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  53.48 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.08 
 
 		 236 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  53.04 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  51.5 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  51.54 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  49.57 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  246  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  49.56 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  51.56 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.35 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  49.57 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  51.29 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.35 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  49.78 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.91 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  46.64 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  45.26 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  231  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  44.54 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.89 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  49.12 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  47.6 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  46.7 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  47.01 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  46.02 
 
 		 235 aa  224  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  47.98 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  46.08 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  45.85 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  44.16 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.19 
 
 		 604 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  45.66 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  47.69 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.85 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.98 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  44.8 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  44.8 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.78 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.09 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.09 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.86 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  44.35 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.89 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  45.7 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.14 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.4 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.24 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  41.67 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.79 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  44.34 
 
 		 652 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.95 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  43.89 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  44.24 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.15 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  42.73 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.14 
 
 		 648 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.14 
 
 		 648 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.55 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  41.63 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>