More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1311 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  62.04 
 
 
229 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  64.84 
 
 
232 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  55.96 
 
 
233 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  62.39 
 
 
234 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  62.39 
 
 
234 aa  234  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  55.22 
 
 
235 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  58.72 
 
 
239 aa  224  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  56.48 
 
 
237 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  58.26 
 
 
246 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  55.3 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  60.66 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  46.58 
 
 
232 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  52.75 
 
 
245 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.39 
 
 
230 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  42.6 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.06 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  50.45 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.12 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  53.05 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
252 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  51.66 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
255 aa  194  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  46.3 
 
 
228 aa  194  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  52.29 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  49.53 
 
 
228 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  48.61 
 
 
238 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  47.73 
 
 
254 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.85 
 
 
239 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  52.78 
 
 
251 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  52.11 
 
 
233 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  45.79 
 
 
224 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.31 
 
 
255 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.98 
 
 
228 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  55.29 
 
 
242 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  49.06 
 
 
237 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 
225 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  49.13 
 
 
271 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
231 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.54 
 
 
280 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  191  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  50 
 
 
268 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  48.17 
 
 
229 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  42.06 
 
 
233 aa  191  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 
240 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  51.16 
 
 
239 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.99 
 
 
240 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.25 
 
 
226 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.85 
 
 
242 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.72 
 
 
225 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  46.33 
 
 
234 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.83 
 
 
272 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  47.03 
 
 
229 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  47.22 
 
 
269 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  44.24 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
234 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  47.66 
 
 
245 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  48.39 
 
 
217 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  51.5 
 
 
217 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  44.44 
 
 
233 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  47.37 
 
 
255 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  49.77 
 
 
248 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  52.56 
 
 
277 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  46.79 
 
 
243 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.68 
 
 
228 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.37 
 
 
229 aa  188  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1417  ABC transporter related  58.82 
 
 
262 aa  188  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.275967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  47.37 
 
 
255 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
245 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  52.76 
 
 
219 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
228 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.2 
 
 
229 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  47.73 
 
 
236 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
229 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 
234 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  49.76 
 
 
258 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.79 
 
 
231 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  47.87 
 
 
228 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  49.07 
 
 
248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.39 
 
 
241 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  43.78 
 
 
241 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>