More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5296 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  86.64 
 
 		 255 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  85.71 
 
 		 230 aa  344  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  81.02 
 
 		 217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  73.15 
 
 		 227 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  76.39 
 
 		 229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  71.76 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  63.89 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 222 aa  257  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  61.75 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  61.11 
 
 		 218 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  62.15 
 
 		 222 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  65.74 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  57.87 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  60.75 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  64.81 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.94 
 
 		 218 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  58.33 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  60.75 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  57.87 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  55.56 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  50.7 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  50.7 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  50.7 
 
 		 236 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  50.7 
 
 		 236 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  48.4 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.4 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  50 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  50 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  50 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  49.52 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  46.35 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.08 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.64 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  47.2 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.64 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.45 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.1 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  43.98 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  48.39 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  43.72 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.78 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  44.34 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43.18 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.95 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.83 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  46.79 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  42.2 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  47.39 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  44.55 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  46.54 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.47 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  42.72 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  45.54 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  47.32 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.53 
 
 		 263 aa  174  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  45.07 
 
 		 255 aa  174  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  44.5 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.34 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.66 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.98 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  44.5 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  42.13 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  47.5 
 
 		 230 aa  173  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  48.39 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  48.31 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  48.29 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  46.08 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.4 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  40.74 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.93 
 
 		 455 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  44.09 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>