More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3627 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  81.86 
 
 
245 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  81.31 
 
 
243 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  67.12 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  60.58 
 
 
225 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  59.81 
 
 
217 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  61.58 
 
 
225 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  61.21 
 
 
214 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
219 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  54.26 
 
 
238 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  58.25 
 
 
225 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  59.33 
 
 
215 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  54.38 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  56.46 
 
 
216 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
224 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  53.69 
 
 
238 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 
245 aa  205  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  50.45 
 
 
255 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.58 
 
 
280 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.44 
 
 
240 aa  198  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  50.23 
 
 
258 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  55.3 
 
 
243 aa  198  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.14 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.05 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.87 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.84 
 
 
264 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  53.81 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.48 
 
 
259 aa  194  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
229 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
266 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  49.32 
 
 
235 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50.69 
 
 
277 aa  191  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.69 
 
 
230 aa  191  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  190  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
229 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  47.79 
 
 
258 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.37 
 
 
249 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.95 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.3 
 
 
242 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.03 
 
 
263 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.29 
 
 
228 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50 
 
 
247 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.17 
 
 
233 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  44.24 
 
 
232 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
264 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.88 
 
 
252 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.22 
 
 
244 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
221 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  49.77 
 
 
243 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  49.77 
 
 
252 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
236 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  48.34 
 
 
445 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.39 
 
 
253 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
255 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  45.76 
 
 
279 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.33 
 
 
225 aa  184  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  47.56 
 
 
250 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.33 
 
 
225 aa  184  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.73 
 
 
233 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  50.73 
 
 
211 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  184  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.73 
 
 
233 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.73 
 
 
233 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  43.18 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  44.74 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.96 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.98 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  42.79 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  50.26 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  43.18 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  50.25 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  51.76 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  51.27 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
246 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.08 
 
 
236 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.88 
 
 
233 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>