More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3469 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  100 
 
 		 216 aa  430  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  76.06 
 
 		 225 aa  313  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  72.9 
 
 		 235 aa  307  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  74.77 
 
 		 215 aa  305  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  71.5 
 
 		 217 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  73.83 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  76.06 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  67.27 
 
 		 238 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  62.04 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  61.5 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  56.28 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  56.74 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  56.46 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  56.57 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  48.85 
 
 		 238 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 255 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.13 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.6 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.55 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  49.54 
 
 		 272 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.27 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  53.08 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.13 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.15 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.33 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  50.5 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.19 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  45.5 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  45.67 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  50.5 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  50.5 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.95 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  47.87 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  43.81 
 
 		 255 aa  174  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  42.03 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.85 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.89 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  43.46 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.07 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  49.07 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.77 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.85 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  46.38 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  49.76 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  48.24 
 
 		 250 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.82 
 
 		 269 aa  171  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.28 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.25 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  46.73 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  45.89 
 
 		 253 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  45.32 
 
 		 253 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.15 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  46.19 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  43.19 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.93 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  45.67 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  48.33 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.87 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  45.54 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.54 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 291 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  43 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  44.13 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  45.41 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  45.28 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  46.67 
 
 		 241 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  41.12 
 
 		 251 aa  167  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  47.87 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  49.29 
 
 		 237 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  45.36 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  49.25 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>