More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1534 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  77.46 
 
 		 215 aa  314  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  78.67 
 
 		 214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  71.5 
 
 		 216 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  74.88 
 
 		 225 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  70.83 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  74.23 
 
 		 225 aa  274  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  68.25 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  64.38 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  64.19 
 
 		 231 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  61.5 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  60.09 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  59.81 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  61 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  57.87 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.3 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.08 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  46.45 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  49.52 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 643 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  47.47 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  49.3 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  45.75 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.19 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.19 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  50 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1866  ABC transporter related  48.24 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.937641  normal  0.767645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.09 
 
 		 238 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.86 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  51.55 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.62 
 
 		 455 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  44.55 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.37 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  47.17 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  49.09 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  52.13 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.26 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.13 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.5 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.02 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45.97 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  48.34 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  46.3 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  50 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  46.86 
 
 		 445 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  47.17 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  45.66 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 		 245 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  52.43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.58 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  45.5 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.84 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1399  ABC transporter related  47.18 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.75 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  48.39 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  45.12 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  50.25 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  48.39 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  47.78 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.78 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.45 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  48.31 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  44.98 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  48.39 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  48.99 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.66 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  46.7 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>