More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2408 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  68.72 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  62.79 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  62.91 
 
 		 227 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  62.79 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  62.79 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  62.96 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  59.43 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  59.35 
 
 		 224 aa  244  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  55.09 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  54.93 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  57.87 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  60.1 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  54.46 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  54.46 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  54.46 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  53.24 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  63.68 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  53.99 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  53.99 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  53.99 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  53.99 
 
 		 246 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  62.38 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  61.93 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  55.88 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  58.16 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 246 aa  235  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  52.78 
 
 		 246 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  55.67 
 
 		 247 aa  234  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  56.48 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  54.98 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  60.09 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  56.93 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  55.67 
 
 		 249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  63.32 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  56.81 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  58.91 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  59.79 
 
 		 200 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  57.82 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  54.38 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  57.92 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  58.69 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  57.92 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  61.5 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 233 aa  227  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  57.43 
 
 		 240 aa  227  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  54.79 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.28 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.28 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.28 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.28 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.28 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  54.79 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 		 237 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  53.52 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  57.92 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  55.71 
 
 		 228 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  59.81 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  54.21 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  53.17 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  54.73 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  54.17 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  54.67 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  59.26 
 
 		 239 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  53.67 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  50.94 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  57 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  57.43 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  48.85 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0650  ABC transporter related  59.9 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.861483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  54.5 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  53.2 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  53 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  61.46 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  55.67 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  61.46 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  54.23 
 
 		 247 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  53.3 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  56.22 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.83 
 
 		 228 aa  217  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>