More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4457 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  68.95 
 
 
256 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  61.37 
 
 
252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.28 
 
 
243 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  61.04 
 
 
245 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  54.33 
 
 
264 aa  271  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.01 
 
 
243 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  57.14 
 
 
255 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.54 
 
 
247 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  56.1 
 
 
279 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  54.01 
 
 
455 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  60.94 
 
 
258 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  54.98 
 
 
255 aa  263  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.66 
 
 
266 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  53.25 
 
 
291 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  55.26 
 
 
445 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.3 
 
 
280 aa  258  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
262 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.72 
 
 
269 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  53.39 
 
 
247 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  57.08 
 
 
253 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  55.22 
 
 
258 aa  255  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  53.25 
 
 
255 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  55.31 
 
 
266 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  52.12 
 
 
256 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  52.42 
 
 
252 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  52.26 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.65 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
271 aa  251  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  56.14 
 
 
268 aa  251  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  55.9 
 
 
261 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
277 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
244 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  51.21 
 
 
255 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  52.12 
 
 
253 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  54.82 
 
 
258 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
249 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.04 
 
 
264 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  59.23 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  58.9 
 
 
257 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  56.94 
 
 
250 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  56.54 
 
 
241 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  51.69 
 
 
250 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  50.43 
 
 
259 aa  238  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.41 
 
 
224 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.71 
 
 
258 aa  236  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53.54 
 
 
272 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.8 
 
 
274 aa  234  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.67 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
255 aa  231  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  51.68 
 
 
288 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
244 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  50 
 
 
271 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.63 
 
 
269 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
255 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.99 
 
 
263 aa  228  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  49.58 
 
 
258 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.38 
 
 
249 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
302 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
279 aa  222  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.72 
 
 
293 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.42 
 
 
245 aa  221  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50.82 
 
 
255 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.05 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.25 
 
 
228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
279 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.41 
 
 
225 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.92 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  51.25 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.52 
 
 
230 aa  198  9e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.33 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.88 
 
 
248 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.47 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.84 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  48.29 
 
 
248 aa  192  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
228 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.09 
 
 
227 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  45 
 
 
217 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.75 
 
 
653 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.08 
 
 
227 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  41.78 
 
 
251 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  41.59 
 
 
252 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  41.59 
 
 
252 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  41.92 
 
 
255 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  47.75 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  43.33 
 
 
259 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.29 
 
 
234 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.14 
 
 
251 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.86 
 
 
225 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.28 
 
 
293 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.72 
 
 
223 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  41.85 
 
 
234 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.29 
 
 
234 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
274 aa  184  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.36 
 
 
238 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>