More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0335 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
227 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.89 
 
 
233 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.22 
 
 
237 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
221 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  44.98 
 
 
657 aa  205  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 
229 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
244 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.02 
 
 
237 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  48.1 
 
 
243 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
229 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.16 
 
 
247 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.17 
 
 
229 aa  202  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  52.4 
 
 
256 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.46 
 
 
226 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.27 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.81 
 
 
235 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.02 
 
 
255 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  48.92 
 
 
293 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.61 
 
 
230 aa  198  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.52 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.23 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.66 
 
 
252 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.3 
 
 
229 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.23 
 
 
229 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.82 
 
 
227 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  45.58 
 
 
656 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  44.55 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.24 
 
 
642 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
658 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.11 
 
 
239 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.42 
 
 
255 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.2 
 
 
239 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  43.03 
 
 
248 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  47.5 
 
 
329 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 
237 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.44 
 
 
230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  45.37 
 
 
247 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  45.41 
 
 
650 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  44.16 
 
 
237 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
226 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.95 
 
 
248 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.13 
 
 
656 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  42.98 
 
 
250 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 
248 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  40.61 
 
 
238 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  43.81 
 
 
241 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
238 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.93 
 
 
245 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  40.16 
 
 
251 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.95 
 
 
248 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  48 
 
 
234 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  46.36 
 
 
226 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.22 
 
 
228 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  48.29 
 
 
253 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  46.44 
 
 
328 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.61 
 
 
225 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 
237 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  41.96 
 
 
238 aa  192  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  47.22 
 
 
255 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  47.35 
 
 
234 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  45.33 
 
 
269 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.32 
 
 
225 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
246 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  43.42 
 
 
648 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  43.42 
 
 
648 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.08 
 
 
242 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
234 aa  191  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  47.87 
 
 
237 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  44.92 
 
 
243 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  41.77 
 
 
682 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  44.4 
 
 
280 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  43.5 
 
 
258 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  44.35 
 
 
252 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  42.44 
 
 
656 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 
227 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
229 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  40.27 
 
 
224 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.64 
 
 
255 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  45.13 
 
 
277 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  44.02 
 
 
241 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  44.35 
 
 
228 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 
226 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.25 
 
 
277 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  44.75 
 
 
238 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
291 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  41.22 
 
 
667 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  41.22 
 
 
667 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
254 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  42.22 
 
 
226 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>