More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2246 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  99.58 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  99.16 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  84.68 
 
 		 238 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  85.59 
 
 		 238 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  60.77 
 
 		 216 aa  274  9e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  60.29 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  60.29 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  61.97 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  56.94 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  57.42 
 
 		 218 aa  262  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  55.98 
 
 		 229 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  54.29 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  59.9 
 
 		 408 aa  255  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  53.33 
 
 		 228 aa  254  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.25 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.33 
 
 		 230 aa  242  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 281 aa  234  7e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  52.26 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.3 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  47.73 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  48.39 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.57 
 
 		 657 aa  201  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.08 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.95 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.41 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.75 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.14 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.47 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.79 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.44 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.59 
 
 		 266 aa  197  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.19 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.96 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  47.93 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.25 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.22 
 
 		 644 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  44.74 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  46.08 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  45.05 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.25 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.32 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45.89 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  42.11 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  48.58 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50.5 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50.5 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.24 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  44.16 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.78 
 
 		 642 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.04 
 
 		 642 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.24 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  45.7 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  45.25 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  44.75 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  48.61 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.02 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  46.48 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.06 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  46.31 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.25 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  42.92 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45.5 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  48.76 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  48.76 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  48.76 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.5 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.47 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.67 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  45.61 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.25 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>