More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1370 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  56.36 
 
 
222 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
234 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  56.36 
 
 
222 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  57.34 
 
 
221 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  54.55 
 
 
228 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  53.18 
 
 
221 aa  244  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 
245 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.73 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.49 
 
 
248 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.49 
 
 
248 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.36 
 
 
228 aa  218  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
226 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.11 
 
 
234 aa  218  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.11 
 
 
234 aa  218  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
226 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  50 
 
 
219 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.91 
 
 
239 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.95 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
226 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.22 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.14 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.87 
 
 
237 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.79 
 
 
228 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
238 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.02 
 
 
253 aa  210  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.73 
 
 
225 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
240 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  45.45 
 
 
249 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
319 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
228 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.45 
 
 
238 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.45 
 
 
236 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 
228 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.09 
 
 
230 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
246 aa  207  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  207  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.62 
 
 
252 aa  207  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
233 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  44.98 
 
 
231 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46.85 
 
 
231 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.8 
 
 
226 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.09 
 
 
224 aa  206  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
233 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.66 
 
 
715 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.06 
 
 
277 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
246 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.42 
 
 
286 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.36 
 
 
235 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.9 
 
 
233 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.09 
 
 
237 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.64 
 
 
225 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  205  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.64 
 
 
225 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45 
 
 
241 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
225 aa  204  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
222 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  43.53 
 
 
241 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  49.25 
 
 
238 aa  203  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.89 
 
 
260 aa  203  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45.83 
 
 
254 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.42 
 
 
235 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.21 
 
 
230 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  45.87 
 
 
233 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  47.51 
 
 
223 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 
237 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  48.39 
 
 
237 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
230 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  51.74 
 
 
237 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  48.4 
 
 
238 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
220 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  45.73 
 
 
241 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.41 
 
 
229 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.25 
 
 
266 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.74 
 
 
230 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  47.3 
 
 
230 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.82 
 
 
241 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  46.33 
 
 
228 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.91 
 
 
240 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
236 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  43.64 
 
 
250 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.78 
 
 
239 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
228 aa  201  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  47.75 
 
 
224 aa  201  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  45.66 
 
 
232 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>