More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1165 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  76.64 
 
 		 216 aa  345  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  76.17 
 
 		 216 aa  344  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  75.7 
 
 		 217 aa  342  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  67.45 
 
 		 229 aa  314  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  66.04 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  61.72 
 
 		 220 aa  284  5.999999999999999e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  60.77 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  57.89 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  59.33 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 237 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  57.42 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  57.42 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.19 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 		 408 aa  254  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.93 
 
 		 265 aa  245  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 281 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 246 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  47.09 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.15 
 
 		 266 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.7 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.25 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  49.25 
 
 		 655 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  51.6 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50.5 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  49.53 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.22 
 
 		 657 aa  207  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.39 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  50.23 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.35 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  49.3 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  49.3 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  49.3 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  48.87 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.8 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.22 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  48.17 
 
 		 249 aa  204  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  48.18 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  48.84 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.33 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  47.91 
 
 		 246 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  45.7 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.74 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  47.81 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  47.44 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.19 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  47.91 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.34 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  47.91 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  47.91 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 236 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50.75 
 
 		 248 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.5 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  201  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50.75 
 
 		 248 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.74 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  49.51 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  47.14 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  46.46 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  47.14 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  43.78 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.05 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.61 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  48.84 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  44.7 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  47.25 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  41.89 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  46.85 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  48.37 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  46.4 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.25 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.66 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  49.75 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  46.05 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  50.25 
 
 		 251 aa  197  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  46.82 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  197  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>