More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0428 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  90.5 
 
 
229 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  69.72 
 
 
220 aa  333  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  66.36 
 
 
228 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  66.04 
 
 
218 aa  310  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  63.98 
 
 
216 aa  304  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  63.03 
 
 
217 aa  300  9e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
238 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  57.42 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.27 
 
 
230 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  57.42 
 
 
237 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  58.37 
 
 
243 aa  268  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
237 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  56.94 
 
 
237 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  56.5 
 
 
408 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  55.71 
 
 
265 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  46.08 
 
 
224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  47.76 
 
 
271 aa  208  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.4 
 
 
277 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.58 
 
 
246 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
233 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.93 
 
 
266 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.91 
 
 
252 aa  205  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.71 
 
 
242 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  46.79 
 
 
248 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  46.79 
 
 
248 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
240 aa  204  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  44.91 
 
 
247 aa  203  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  42.86 
 
 
236 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.29 
 
 
232 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  48.37 
 
 
228 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 
228 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
228 aa  201  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.78 
 
 
252 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  46.15 
 
 
223 aa  201  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.32 
 
 
228 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  45.45 
 
 
657 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.75 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.41 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  49.08 
 
 
280 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.76 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.64 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.88 
 
 
234 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.83 
 
 
228 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.88 
 
 
234 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  44.75 
 
 
229 aa  199  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  42.92 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.76 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  43.84 
 
 
655 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 
228 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.53 
 
 
225 aa  197  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
228 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  47.26 
 
 
230 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.85 
 
 
227 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.18 
 
 
230 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 
658 aa  197  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  46.38 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  44.61 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.99 
 
 
648 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  46.77 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  44.7 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  44.61 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.8 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.62 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.78 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  45.41 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  45.02 
 
 
641 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
227 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.95 
 
 
226 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.75 
 
 
236 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.59 
 
 
237 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  43.58 
 
 
241 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  46.4 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  43.38 
 
 
291 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  45.58 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  44.75 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  44.55 
 
 
641 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  42.08 
 
 
229 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.87 
 
 
234 aa  194  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 
233 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.06 
 
 
237 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  48.76 
 
 
231 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
229 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  43.53 
 
 
249 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  49.25 
 
 
229 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  43.38 
 
 
228 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
248 aa  192  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>