More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0083 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  100 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  89.09 
 
 
222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  89.55 
 
 
222 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  89.14 
 
 
221 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  75.11 
 
 
234 aa  349  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  76.47 
 
 
221 aa  344  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  62.56 
 
 
219 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  54.55 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  54.26 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.57 
 
 
252 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
233 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.09 
 
 
229 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
228 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.92 
 
 
242 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50 
 
 
228 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.55 
 
 
232 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.18 
 
 
240 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.18 
 
 
237 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
230 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  49.1 
 
 
248 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
232 aa  223  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.08 
 
 
248 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.95 
 
 
240 aa  223  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.09 
 
 
239 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.08 
 
 
248 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.43 
 
 
230 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.73 
 
 
230 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.91 
 
 
226 aa  222  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  49.32 
 
 
228 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
246 aa  221  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.44 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  49.55 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.25 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.32 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 
227 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  47.58 
 
 
248 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.73 
 
 
237 aa  218  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
228 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.32 
 
 
253 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  48.2 
 
 
239 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 
224 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.1 
 
 
238 aa  217  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
236 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  47.95 
 
 
248 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  49.09 
 
 
241 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
241 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.71 
 
 
242 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
408 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.82 
 
 
241 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.23 
 
 
238 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  49.09 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.18 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
228 aa  215  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.66 
 
 
277 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
222 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.34 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.54 
 
 
224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 
228 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.84 
 
 
654 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.09 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  49.55 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.66 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.84 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.51 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  46.19 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  47.09 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  211  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  211  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.86 
 
 
236 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
240 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
254 aa  211  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.32 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.95 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
226 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  45.74 
 
 
227 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.03 
 
 
888 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
246 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.64 
 
 
234 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
228 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.58 
 
 
236 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.61 
 
 
258 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  51.57 
 
 
223 aa  209  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>