More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1835 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
217 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  99.54 
 
 
216 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  99.07 
 
 
216 aa  434  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  75.7 
 
 
218 aa  342  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  64.93 
 
 
229 aa  304  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  64.15 
 
 
220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  63.03 
 
 
224 aa  300  8.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  62.38 
 
 
243 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  61.32 
 
 
228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  61.24 
 
 
238 aa  278  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  60.77 
 
 
238 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  60.29 
 
 
237 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  60.29 
 
 
237 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  60.29 
 
 
237 aa  272  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 
408 aa  266  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.42 
 
 
230 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
281 aa  256  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  55.45 
 
 
265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  51.39 
 
 
224 aa  225  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
230 aa  215  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  50.9 
 
 
250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.79 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48.87 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  50.93 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  51.9 
 
 
246 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50 
 
 
248 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50 
 
 
248 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  52.97 
 
 
247 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
246 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 
246 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  48.18 
 
 
228 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
235 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49 
 
 
238 aa  202  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  48.73 
 
 
226 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 
228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.75 
 
 
225 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  46.54 
 
 
235 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  50 
 
 
249 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  49.77 
 
 
249 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  46.33 
 
 
221 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.54 
 
 
235 aa  201  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 
227 aa  201  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.58 
 
 
252 aa  201  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.95 
 
 
254 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  45.96 
 
 
247 aa  201  7e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  48.39 
 
 
220 aa  201  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.39 
 
 
644 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.36 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  49.33 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  49.33 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.04 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  46.85 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  49.33 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  49.33 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  49.33 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.75 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.21 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.03 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  49.32 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  49.32 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  50.25 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
234 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
222 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  46.76 
 
 
221 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  46.08 
 
 
655 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.8 
 
 
235 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.77 
 
 
657 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  48.61 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  45.5 
 
 
249 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  198  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  45.62 
 
 
230 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
224 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 
253 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  45.37 
 
 
254 aa  198  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 
658 aa  198  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  45.41 
 
 
222 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.5 
 
 
225 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  46.36 
 
 
228 aa  198  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  45.66 
 
 
232 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.51 
 
 
228 aa  198  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  44.55 
 
 
648 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  44.55 
 
 
648 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  42.99 
 
 
228 aa  197  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.24 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  50 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  44.5 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.91 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  44.34 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.66 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  46.82 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.3 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.3 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>