More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4327 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8188  ABC transporter related protein  74.44 
 
 
225 aa  320  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8553  ABC transporter related protein  62.27 
 
 
278 aa  300  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  58.45 
 
 
655 aa  275  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  61.99 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.73 
 
 
235 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  61.82 
 
 
240 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  60.45 
 
 
244 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  53.92 
 
 
246 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  58.18 
 
 
231 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  53.18 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  49.11 
 
 
232 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.18 
 
 
225 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
228 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  53.42 
 
 
291 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  49.33 
 
 
248 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.95 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.95 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  48.66 
 
 
228 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  46.88 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  51.72 
 
 
235 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.05 
 
 
230 aa  214  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.27 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.95 
 
 
259 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 
228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  50.23 
 
 
241 aa  211  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
228 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
228 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
246 aa  207  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.27 
 
 
240 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
238 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.15 
 
 
252 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.64 
 
 
229 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  48.39 
 
 
254 aa  205  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.77 
 
 
236 aa  205  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.23 
 
 
238 aa  204  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.26 
 
 
226 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
227 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50 
 
 
238 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
233 aa  203  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
228 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.33 
 
 
242 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
233 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47.27 
 
 
228 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.87 
 
 
224 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  53.88 
 
 
291 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
255 aa  201  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  50.7 
 
 
276 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.27 
 
 
228 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  47.93 
 
 
240 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.58 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.01 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.11 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  53.92 
 
 
254 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.78 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.27 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.7 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 
243 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
218 aa  199  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.51 
 
 
226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.27 
 
 
233 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
216 aa  198  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
217 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.42 
 
 
228 aa  198  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
229 aa  198  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  48.61 
 
 
235 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
216 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  48.18 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.09 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  49.09 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  46.15 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.5 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.08 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.26 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.49 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
227 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  49.08 
 
 
243 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
228 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50.92 
 
 
256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  45.62 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.33 
 
 
241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>