More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0685 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  69.72 
 
 
225 aa  315  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  68.35 
 
 
225 aa  314  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  67.89 
 
 
229 aa  311  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  64.22 
 
 
235 aa  292  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
230 aa  281  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  61.19 
 
 
240 aa  275  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  57.8 
 
 
226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  60.09 
 
 
236 aa  272  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  58.26 
 
 
234 aa  263  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  56.94 
 
 
220 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
238 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  55.5 
 
 
225 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 
237 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  55.56 
 
 
220 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  55.96 
 
 
227 aa  251  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.67 
 
 
230 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.67 
 
 
225 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  52.97 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  52.51 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
246 aa  242  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  51.6 
 
 
244 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  53.67 
 
 
232 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  54.13 
 
 
230 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  52.31 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  53.21 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
248 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  53.21 
 
 
246 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  53.21 
 
 
246 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  53.21 
 
 
246 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.29 
 
 
232 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  52.29 
 
 
653 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  52.29 
 
 
234 aa  235  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.83 
 
 
230 aa  235  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  52.29 
 
 
263 aa  235  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  52.75 
 
 
246 aa  235  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  51.83 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  51.83 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  51.83 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  51.83 
 
 
247 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  51.83 
 
 
253 aa  234  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  52.29 
 
 
246 aa  234  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  51.38 
 
 
241 aa  234  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.38 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  52.29 
 
 
240 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  51.83 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.36 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  52.75 
 
 
658 aa  231  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  51.6 
 
 
242 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  51.38 
 
 
244 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
243 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  53.18 
 
 
230 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50 
 
 
238 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  52.29 
 
 
229 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  51.83 
 
 
222 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  51.83 
 
 
222 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.38 
 
 
266 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  51.83 
 
 
222 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  51.38 
 
 
240 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  52.29 
 
 
229 aa  228  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  51.38 
 
 
233 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  52.75 
 
 
241 aa  228  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  49.54 
 
 
224 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.6 
 
 
235 aa  228  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.39 
 
 
235 aa  228  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.29 
 
 
226 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
224 aa  227  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 
224 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 
253 aa  227  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.38 
 
 
226 aa  227  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.08 
 
 
228 aa  227  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.14 
 
 
253 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  55.28 
 
 
211 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.46 
 
 
239 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.14 
 
 
228 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
241 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  50.23 
 
 
236 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
226 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.38 
 
 
242 aa  225  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
232 aa  225  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>