More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  64.22 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  60.19 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 218 aa  235  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  56.74 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  56.81 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  56.71 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  55.91 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.23 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  54.91 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.21 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.88 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.88 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  46.33 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  49.77 
 
 		 655 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  49.78 
 
 		 654 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  54.71 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  54.71 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.67 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.48 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.7 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.51 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  54.26 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.71 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.71 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.05 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.07 
 
 		 648 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.07 
 
 		 648 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 654 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.07 
 
 		 648 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.07 
 
 		 648 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.53 
 
 		 647 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  48.1 
 
 		 654 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  54.59 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.07 
 
 		 648 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  47.7 
 
 		 657 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  47.68 
 
 		 663 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  47.48 
 
 		 663 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.89 
 
 		 226 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.85 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  50.89 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.82 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.91 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.52 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.61 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.8 
 
 		 266 aa  205  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  45.62 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.67 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.68 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  47.6 
 
 		 657 aa  204  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  48.15 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  52.88 
 
 		 668 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  52.88 
 
 		 668 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.7 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.84 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.58 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.43 
 
 		 646 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.37 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  48.72 
 
 		 654 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.03 
 
 		 254 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  47.09 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.32 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  51.14 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  54.02 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.4 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8188  ABC transporter related protein  53.92 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.04 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  46.4 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.77 
 
 		 653 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  46.64 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  47.95 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  47.95 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  48.87 
 
 		 687 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  49.13 
 
 		 650 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  46.15 
 
 		 653 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  46.82 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>