More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4787 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  66.51 
 
 
252 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  68.81 
 
 
230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  65.42 
 
 
235 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  65.57 
 
 
227 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  65.71 
 
 
276 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  67.14 
 
 
242 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
227 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.14 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  51.14 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
218 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.71 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.68 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.83 
 
 
224 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  49.33 
 
 
652 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.21 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
224 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
246 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  52.75 
 
 
248 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.02 
 
 
236 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.73 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.23 
 
 
236 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  52.78 
 
 
228 aa  218  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  49.77 
 
 
247 aa  218  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
228 aa  218  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
240 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.07 
 
 
230 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  52.05 
 
 
654 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  54.88 
 
 
240 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.46 
 
 
226 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  57.67 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.98 
 
 
237 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
228 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  51.08 
 
 
661 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
246 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  51.56 
 
 
653 aa  214  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  56.74 
 
 
241 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  51.85 
 
 
655 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  56.74 
 
 
241 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  56.28 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  48.85 
 
 
671 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  46.35 
 
 
666 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  52.94 
 
 
663 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.32 
 
 
649 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  51.96 
 
 
226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
219 aa  212  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  48.02 
 
 
653 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.32 
 
 
646 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
260 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.87 
 
 
649 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
226 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  53.55 
 
 
650 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.44 
 
 
260 aa  210  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  47.88 
 
 
663 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.5 
 
 
238 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.44 
 
 
228 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
228 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
236 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  55.22 
 
 
288 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
232 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.3 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.15 
 
 
248 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  48.43 
 
 
652 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  47.95 
 
 
667 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  47.95 
 
 
667 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.63 
 
 
236 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.15 
 
 
648 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.15 
 
 
648 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.33 
 
 
648 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.75 
 
 
235 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  49.32 
 
 
244 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  48.4 
 
 
653 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  50.23 
 
 
648 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  49.78 
 
 
654 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.56 
 
 
235 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.76 
 
 
234 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
226 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  47.49 
 
 
682 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  45.5 
 
 
648 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>