More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0307 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  75 
 
 
227 aa  316  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  68.98 
 
 
276 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  66.21 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  68.35 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  69.91 
 
 
242 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  68.81 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  66.36 
 
 
227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  65.12 
 
 
218 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.47 
 
 
239 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.47 
 
 
232 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.58 
 
 
225 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.25 
 
 
225 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.57 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
233 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
240 aa  230  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.88 
 
 
235 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
246 aa  230  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  54.46 
 
 
230 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 
226 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.91 
 
 
238 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.31 
 
 
237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.77 
 
 
230 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
248 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50.23 
 
 
252 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  56.62 
 
 
260 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.42 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  48.67 
 
 
250 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.71 
 
 
248 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.71 
 
 
248 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.79 
 
 
260 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
224 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50.67 
 
 
225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  46.61 
 
 
224 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
226 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  50.23 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.54 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  51.74 
 
 
291 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.54 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
232 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  51.53 
 
 
666 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  58.74 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.47 
 
 
242 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.75 
 
 
228 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  56.95 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.51 
 
 
226 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.31 
 
 
235 aa  216  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  50.68 
 
 
228 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  51.1 
 
 
663 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.55 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  51.12 
 
 
663 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.32 
 
 
238 aa  215  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.75 
 
 
244 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.52 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50.22 
 
 
228 aa  214  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  56.42 
 
 
276 aa  214  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.42 
 
 
238 aa  214  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.66 
 
 
235 aa  214  9e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.29 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.45 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  49.32 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.9 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  47.69 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50.45 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  55.86 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  52.04 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.87 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.2 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  49.32 
 
 
654 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  47.22 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  44.64 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
236 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  50.93 
 
 
288 aa  211  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.44 
 
 
235 aa  211  7e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.4 
 
 
252 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.62 
 
 
652 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>