More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2038 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.16 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.75 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.78 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.25 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  54.91 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.75 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  54.02 
 
 		 254 aa  244  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.27 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  52.89 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.61 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.38 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  54.63 
 
 		 228 aa  241  7e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  53.64 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  51.6 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.25 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  52.75 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  57.01 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.79 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  57.21 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 232 aa  238  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.68 
 
 		 226 aa  237  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.95 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  51.61 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  51.83 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  54.09 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  52.7 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  51.83 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.95 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  55.95 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  55.91 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  53.46 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  53.46 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  52.27 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.82 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.83 
 
 		 266 aa  235  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  52.63 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 		 658 aa  234  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  52.73 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  52.04 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  51.79 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  56.19 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  51.8 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  53.46 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  51.35 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  52.73 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.23 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  51.35 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.88 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.88 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.53 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  51.82 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.53 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  55.92 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.57 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  51.36 
 
 		 653 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  55.45 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.88 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  51.79 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  51.8 
 
 		 653 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.82 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.43 
 
 		 247 aa  227  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  55.45 
 
 		 654 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.79 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  52.68 
 
 		 226 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  51.8 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  54.5 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  49.78 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  51.97 
 
 		 241 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  54.05 
 
 		 668 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  54.05 
 
 		 668 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  48.65 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  47.62 
 
 		 648 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  52.51 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  47.62 
 
 		 648 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  53.36 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>