More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5942 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  100 
 
 
227 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  75 
 
 
230 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  69.72 
 
 
242 aa  284  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  64.65 
 
 
276 aa  271  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  62.33 
 
 
252 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  62.33 
 
 
218 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  63.84 
 
 
235 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  65.57 
 
 
260 aa  258  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  64.52 
 
 
227 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.68 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.81 
 
 
238 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.38 
 
 
225 aa  224  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.92 
 
 
225 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  49.54 
 
 
220 aa  218  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
248 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.54 
 
 
230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
220 aa  215  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
232 aa  214  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 
260 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
246 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.25 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.95 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.95 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
233 aa  211  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
236 aa  210  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.25 
 
 
239 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  51.61 
 
 
233 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.25 
 
 
232 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
225 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 
226 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.64 
 
 
237 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
226 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50.92 
 
 
244 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
230 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  47.51 
 
 
233 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.62 
 
 
252 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.25 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
229 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.83 
 
 
291 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  46.78 
 
 
653 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
219 aa  205  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  56.11 
 
 
276 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  49.1 
 
 
236 aa  204  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 
228 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  49.09 
 
 
250 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 
219 aa  203  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.5 
 
 
260 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.33 
 
 
646 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  46.05 
 
 
228 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.16 
 
 
242 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.58 
 
 
239 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.18 
 
 
238 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
239 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  51.82 
 
 
291 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.86 
 
 
277 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.79 
 
 
266 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  47.91 
 
 
246 aa  201  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  47.91 
 
 
246 aa  201  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  47.44 
 
 
232 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  47.91 
 
 
246 aa  201  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  46.54 
 
 
228 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
228 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  47.35 
 
 
654 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  46.79 
 
 
650 aa  201  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 
253 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
227 aa  201  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.71 
 
 
224 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  53.73 
 
 
241 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  53.73 
 
 
241 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
253 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.24 
 
 
226 aa  201  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  46.33 
 
 
254 aa  201  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.82 
 
 
253 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.73 
 
 
247 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  48.4 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.35 
 
 
259 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>