More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4071 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  67.11 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  66.21 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25290  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  67.13 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  66.51 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  62.33 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  64.06 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.22 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  62.33 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 227 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.67 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.55 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.75 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.51 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.44 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.62 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.4 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.4 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.75 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.09 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  52.77 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  54.38 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.75 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.21 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.21 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.06 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  53.12 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  53.12 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  53.12 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.19 
 
 		 226 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  49.77 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  47.75 
 
 		 653 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.7 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.15 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.21 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.55 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.51 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.65 
 
 		 653 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.64 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.79 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  50.67 
 
 		 663 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  52.91 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.94 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  52 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  50.22 
 
 		 663 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.54 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.51 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  49.5 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.02 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  49.75 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.09 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  46.88 
 
 		 654 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  48.51 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.5 
 
 		 254 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  48.51 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  48.51 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  52.2 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  46.61 
 
 		 653 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  49.75 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.59 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>