More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8188 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8188  ABC transporter related protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  74.11 
 
 		 224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8553  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 278 aa  297  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  60.27 
 
 		 655 aa  279  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  63.06 
 
 		 251 aa  269  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.18 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  62.27 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  51.1 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  49.55 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.95 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  51.47 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  48.21 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.73 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.33 
 
 		 230 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.54 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.92 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.18 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  46.43 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  51.56 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  50 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  50 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  48.65 
 
 		 654 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.82 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.15 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.41 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.41 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.74 
 
 		 254 aa  205  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1626  ABC transporter related  50.68 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  51.82 
 
 		 271 aa  204  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.12 
 
 		 239 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  45.05 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45.83 
 
 		 259 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.75 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  49.11 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  46.82 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.5 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 646 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.95 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.73 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.79 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.43 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  46.36 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 658 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.31 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3462  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  44.8 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.51 
 
 		 644 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.5 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.71 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  53.92 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  45.95 
 
 		 655 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  51.61 
 
 		 291 aa  197  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 		 243 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  45.66 
 
 		 235 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  197  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.65 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 		 255 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.95 
 
 		 648 aa  197  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  46.12 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  50.91 
 
 		 707 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.25 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0479  ABC transporter related  51.13 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  43.69 
 
 		 652 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>