More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3501 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  70.51 
 
 
246 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  70.51 
 
 
246 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  70.51 
 
 
246 aa  342  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  70.34 
 
 
253 aa  341  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  72.97 
 
 
247 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  72.85 
 
 
263 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  73.3 
 
 
247 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  71.12 
 
 
232 aa  340  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  73.3 
 
 
246 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  73.3 
 
 
247 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  73.3 
 
 
246 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  73.3 
 
 
240 aa  338  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  72.85 
 
 
246 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  72.4 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  72.4 
 
 
240 aa  335  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  70.72 
 
 
230 aa  329  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  69.68 
 
 
247 aa  325  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  68.66 
 
 
233 aa  316  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  62.44 
 
 
253 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 
240 aa  258  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  53.02 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
220 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 
237 aa  248  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.82 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  52.05 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  51.6 
 
 
235 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  51.39 
 
 
220 aa  240  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
241 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.39 
 
 
237 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
246 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  48.62 
 
 
236 aa  238  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.82 
 
 
258 aa  236  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  48.89 
 
 
229 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.64 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.36 
 
 
225 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  47.25 
 
 
235 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
225 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.09 
 
 
237 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
248 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.79 
 
 
242 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.86 
 
 
239 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
230 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 
222 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  48.62 
 
 
222 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 
248 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
222 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  52.51 
 
 
236 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  52.51 
 
 
240 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.08 
 
 
291 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
227 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  49.09 
 
 
233 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.78 
 
 
242 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
233 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
228 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
228 aa  222  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.45 
 
 
238 aa  221  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.5 
 
 
226 aa  221  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.79 
 
 
236 aa  221  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.82 
 
 
226 aa  221  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.35 
 
 
260 aa  220  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.22 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  47.77 
 
 
655 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.27 
 
 
266 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.79 
 
 
247 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
238 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.9 
 
 
647 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  49.77 
 
 
277 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.87 
 
 
228 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
228 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.79 
 
 
252 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  46.09 
 
 
244 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  46.29 
 
 
238 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.96 
 
 
253 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
240 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  46.79 
 
 
229 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.82 
 
 
244 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.12 
 
 
235 aa  216  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.81 
 
 
233 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
230 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.25 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  47.79 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.81 
 
 
233 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.58 
 
 
241 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.25 
 
 
229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.27 
 
 
236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
224 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
224 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  49.08 
 
 
291 aa  214  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>