More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0479 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0479  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0815  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0374  ABC transporter related  50.45 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8188  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  47.95 
 
 		 251 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  44.55 
 
 		 655 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.81 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.27 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  46.19 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  45.85 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  39.91 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.64 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  43.65 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  41.01 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  39.55 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.86 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 408 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  41.33 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.33 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 646 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  46 
 
 		 234 aa  177  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 237 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.38 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  43.33 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  44.14 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  42.67 
 
 		 658 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  38.05 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  41.44 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  42.92 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  42.06 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  43.32 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  42.01 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  44.95 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2233  ABC transporter related  42.53 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  41.15 
 
 		 657 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3477  ABC transporter related  44.54 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  43.84 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.1 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.73 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  46.51 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  39.01 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  39.37 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  44.88 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  40.55 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  37.61 
 
 		 648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  38.67 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  40.36 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  41.63 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  41.28 
 
 		 654 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  38.46 
 
 		 241 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.99 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  41.51 
 
 		 655 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.17 
 
 		 648 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 648 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.44 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 654 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  43.81 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  40.1 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  44.61 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.61 
 
 		 648 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  39.2 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>