More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1330 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  79.57 
 
 
236 aa  387  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  61.06 
 
 
229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  63.84 
 
 
225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  64.22 
 
 
219 aa  292  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  59.38 
 
 
225 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  56.95 
 
 
230 aa  275  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  56.05 
 
 
226 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  56.5 
 
 
240 aa  265  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  56.05 
 
 
234 aa  261  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  53.67 
 
 
238 aa  248  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  53.92 
 
 
220 aa  245  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  53.64 
 
 
220 aa  245  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 
237 aa  241  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 
241 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
244 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.58 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
223 aa  234  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  51.09 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  50.66 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  47.25 
 
 
241 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  49.08 
 
 
227 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  51.77 
 
 
243 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
240 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  49.54 
 
 
232 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
253 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.11 
 
 
239 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  50.93 
 
 
243 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.09 
 
 
232 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 
246 aa  224  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
222 aa  224  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  50 
 
 
222 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.2 
 
 
225 aa  224  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
222 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  48.68 
 
 
246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  48.68 
 
 
246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  48.68 
 
 
246 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
228 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  48.84 
 
 
233 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  46.79 
 
 
247 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.5 
 
 
225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  49.08 
 
 
246 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.53 
 
 
226 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  49.08 
 
 
247 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  49.08 
 
 
247 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  49.08 
 
 
247 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  221  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  48.17 
 
 
253 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  49.54 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  48.62 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.88 
 
 
657 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  48.17 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  46.61 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  46.61 
 
 
229 aa  218  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.95 
 
 
228 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
226 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
230 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.38 
 
 
642 aa  216  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  46.58 
 
 
249 aa  215  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
238 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
233 aa  215  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  46.85 
 
 
234 aa  215  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  45.5 
 
 
671 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.54 
 
 
235 aa  214  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
248 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.15 
 
 
230 aa  214  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.87 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.54 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.17 
 
 
647 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.24 
 
 
653 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.44 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.2 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  42.73 
 
 
654 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  42.86 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  46.58 
 
 
220 aa  211  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.14 
 
 
238 aa  211  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  210  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.3 
 
 
238 aa  210  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.98 
 
 
266 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.25 
 
 
239 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
228 aa  209  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
229 aa  209  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>