More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2233 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2233  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  52 
 
 
654 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.25 
 
 
237 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 
224 aa  201  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
233 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
226 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
226 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  47.56 
 
 
671 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
228 aa  198  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.42 
 
 
644 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  41.96 
 
 
224 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.7 
 
 
646 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.95 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.62 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
236 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
236 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.3 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.69 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  47.06 
 
 
225 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.45 
 
 
648 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.67 
 
 
235 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.45 
 
 
648 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.45 
 
 
648 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
225 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 
255 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.21 
 
 
277 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.8 
 
 
242 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
228 aa  191  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  46.7 
 
 
661 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.27 
 
 
650 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
238 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.5 
 
 
230 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
648 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
246 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  46.4 
 
 
264 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 
648 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45 
 
 
648 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45 
 
 
648 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 
228 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  44 
 
 
657 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.44 
 
 
247 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  45.25 
 
 
229 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  44.98 
 
 
657 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  46.43 
 
 
652 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.2 
 
 
260 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
219 aa  188  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  42.53 
 
 
233 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  42.53 
 
 
235 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  43.89 
 
 
239 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.8 
 
 
647 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
231 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  43.44 
 
 
236 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  47.06 
 
 
235 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  42.73 
 
 
228 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.47 
 
 
226 aa  186  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  42.36 
 
 
236 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.92 
 
 
241 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  44.29 
 
 
220 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.64 
 
 
236 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  44.64 
 
 
654 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
225 aa  185  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  45.29 
 
 
652 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.11 
 
 
648 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.99 
 
 
244 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  41.87 
 
 
647 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  41.18 
 
 
236 aa  184  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  42.86 
 
 
230 aa  184  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  42.41 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  45.18 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  46.82 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  45.98 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  41.56 
 
 
656 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  44.14 
 
 
652 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>