More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3474 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  100 
 
 		 655 aa  1299    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  51.15 
 
 		 407 aa  347  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  50.76 
 
 		 391 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  47.22 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  46.17 
 
 		 495 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  49.87 
 
 		 391 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  50 
 
 		 392 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.38 
 
 		 648 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  47.24 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  45.2 
 
 		 414 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  30.15 
 
 		 652 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  32.51 
 
 		 653 aa  280  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.98 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.42 
 
 		 667 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.7 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.52 
 
 		 649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  32.2 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  58.45 
 
 		 224 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.05 
 
 		 663 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.4 
 
 		 656 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.99 
 
 		 667 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.63 
 
 		 648 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  32.73 
 
 		 648 aa  270  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.62 
 
 		 648 aa  270  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.93 
 
 		 648 aa  270  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.41 
 
 		 663 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  32.4 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.63 
 
 		 648 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.63 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  58.18 
 
 		 240 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8188  ABC transporter related protein  60.27 
 
 		 225 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.16 
 
 		 657 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.83 
 
 		 682 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  33.14 
 
 		 657 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.51 
 
 		 649 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  29.99 
 
 		 653 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.5 
 
 		 682 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.33 
 
 		 646 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.82 
 
 		 648 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  30.4 
 
 		 641 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  32.6 
 
 		 656 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  33.33 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.18 
 
 		 653 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  30.34 
 
 		 641 aa  262  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 648 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 244 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  259  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.31 
 
 		 647 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.75 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  30.38 
 
 		 651 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.66 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.66 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.66 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.98 
 
 		 235 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  30.55 
 
 		 652 aa  257  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  32.28 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.18 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  30.45 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.18 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.85 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.85 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.18 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  56.31 
 
 		 251 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.41 
 
 		 640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.53 
 
 		 644 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.45 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  31.72 
 
 		 654 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  32.93 
 
 		 643 aa  250  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.72 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.72 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.72 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  31.91 
 
 		 654 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  30.49 
 
 		 681 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  30.49 
 
 		 681 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.91 
 
 		 661 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  30.71 
 
 		 687 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  31.03 
 
 		 656 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.99 
 
 		 647 aa  241  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  33.53 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  32.69 
 
 		 670 aa  239  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8553  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 278 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.35 
 
 		 652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  54.5 
 
 		 231 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 246 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.33 
 
 		 248 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.33 
 
 		 248 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 		 228 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  31.41 
 
 		 652 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  31.6 
 
 		 660 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 658 aa  230  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  51.83 
 
 		 252 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.75 
 
 		 651 aa  226  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 227 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  49.11 
 
 		 228 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.38 
 
 		 252 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  48.66 
 
 		 228 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>