More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4326 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  100 
 
 
391 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  73.4 
 
 
391 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  71.39 
 
 
392 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  49.87 
 
 
655 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
407 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  47.24 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  45.14 
 
 
495 aa  302  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  47.62 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  47.09 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  36.43 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  34.58 
 
 
424 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 
422 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
403 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.22 
 
 
397 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  29.82 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  31.17 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.96 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  31.04 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.66 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  30.49 
 
 
397 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.58 
 
 
417 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.28 
 
 
397 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
400 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  29.14 
 
 
681 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  24.32 
 
 
417 aa  106  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  29.5 
 
 
425 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  29.14 
 
 
681 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
405 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  28.18 
 
 
687 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
408 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.41 
 
 
443 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
410 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
387 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
397 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  29.37 
 
 
397 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
413 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
418 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.38 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.53 
 
 
410 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
416 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.45 
 
 
653 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.85 
 
 
405 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
403 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 
405 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
421 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  28.93 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  25.17 
 
 
412 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  27.29 
 
 
666 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
398 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  28.16 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  26.04 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.3 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  28.61 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.29 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  25.42 
 
 
656 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.75 
 
 
643 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  29.78 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  29.78 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  38.67 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0028  ABC transporter related protein  27.87 
 
 
628 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.43 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.62 
 
 
652 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.3 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.24 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.21 
 
 
653 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.15 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  25.06 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  26.02 
 
 
653 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  27.41 
 
 
419 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  23.78 
 
 
412 aa  94  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.09 
 
 
385 aa  94  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  27.29 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.71 
 
 
658 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 
420 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  40.44 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  40.44 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  40.44 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  40.44 
 
 
391 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
384 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
383 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  40.44 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
383 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 
407 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  26.29 
 
 
645 aa  92.8  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>