More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8189 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  100 
 
 
392 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  78.06 
 
 
391 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  70.92 
 
 
391 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  50 
 
 
655 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  50.25 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  48.74 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  45.64 
 
 
495 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  47.88 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  46.58 
 
 
414 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  37.41 
 
 
425 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  26.5 
 
 
393 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  30.71 
 
 
406 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.28 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  24.71 
 
 
415 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
405 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
405 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.74 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.85 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.82 
 
 
417 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 
420 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
402 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.14 
 
 
409 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  34.67 
 
 
438 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
409 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
409 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  29.7 
 
 
420 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  29.46 
 
 
410 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.84 
 
 
392 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
403 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
408 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 
413 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  25.42 
 
 
404 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  27.02 
 
 
394 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
409 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.72 
 
 
391 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
408 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
405 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.69 
 
 
397 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
392 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.88 
 
 
410 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
410 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.5 
 
 
385 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  29.26 
 
 
404 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 
400 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
421 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.5 
 
 
419 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
405 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
416 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
406 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  46.96 
 
 
400 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 
404 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  28.05 
 
 
397 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  44.35 
 
 
409 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.42 
 
 
405 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.14 
 
 
407 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  25.54 
 
 
398 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
417 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
380 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  28.99 
 
 
415 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.21 
 
 
409 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  29.7 
 
 
397 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.92 
 
 
409 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 
406 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.02 
 
 
398 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  27.59 
 
 
421 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 
413 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.49 
 
 
413 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 
412 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  42.61 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  26.15 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0028  ABC transporter related protein  30.11 
 
 
628 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.44 
 
 
681 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  27.67 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  25.54 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  24.47 
 
 
653 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  47.83 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  31.16 
 
 
408 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  30.27 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.44 
 
 
681 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.12 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  26.72 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.12 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.74 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  26.72 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  38.81 
 
 
454 aa  97.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.13 
 
 
643 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>