More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0682 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
404 aa  806    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  55.2 
 
 
403 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  50 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  47.28 
 
 
404 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  47.77 
 
 
404 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.71 
 
 
391 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 
401 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
420 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 
420 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.17 
 
 
394 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  33.17 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.38 
 
 
409 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  30.73 
 
 
398 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  30.38 
 
 
410 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.24 
 
 
405 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.19 
 
 
443 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
406 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  30.38 
 
 
410 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.53 
 
 
409 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.43 
 
 
405 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.21 
 
 
412 aa  167  4e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  31.67 
 
 
402 aa  166  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.93 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.1 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.61 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  30.77 
 
 
397 aa  162  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
409 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 
410 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.55 
 
 
405 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.59 
 
 
409 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
397 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 
407 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  33.1 
 
 
408 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.79 
 
 
409 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.26 
 
 
407 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.08 
 
 
400 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.89 
 
 
403 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
409 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 
405 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.68 
 
 
410 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
405 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.9 
 
 
394 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
405 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.5 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 
410 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
404 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
405 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32.34 
 
 
412 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  29.37 
 
 
687 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.41 
 
 
397 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  30.05 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  30.19 
 
 
681 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
658 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  30.19 
 
 
681 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.04 
 
 
411 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.01 
 
 
657 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.45 
 
 
399 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.45 
 
 
409 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.45 
 
 
409 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
406 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.85 
 
 
656 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  28.89 
 
 
435 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
405 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
406 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 
392 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.66 
 
 
403 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.41 
 
 
653 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.41 
 
 
653 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.41 
 
 
653 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.12 
 
 
401 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.43 
 
 
394 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 
656 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
452 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  30.26 
 
 
641 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.38 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  27.79 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.38 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  30.02 
 
 
641 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.12 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.32 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.38 
 
 
413 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.98 
 
 
641 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.18 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  30.02 
 
 
641 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  27.38 
 
 
667 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  30.5 
 
 
414 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.69 
 
 
648 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 
646 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>