More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3129 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
406 aa  814    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  70.69 
 
 
406 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  56.16 
 
 
406 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  44.33 
 
 
405 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  49.26 
 
 
402 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  48.17 
 
 
408 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  41.39 
 
 
715 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  47.06 
 
 
409 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  48.88 
 
 
409 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  48.38 
 
 
409 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.75 
 
 
406 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  48.26 
 
 
409 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  40.83 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  41.87 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  41.08 
 
 
409 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  43.03 
 
 
401 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  40.83 
 
 
409 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 
405 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  46.31 
 
 
409 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  41.18 
 
 
707 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  40.3 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  41.58 
 
 
401 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  40 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
658 aa  308  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  40.49 
 
 
653 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  41.09 
 
 
401 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  41.09 
 
 
401 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.31 
 
 
403 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.55 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  38.18 
 
 
402 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  38.18 
 
 
402 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  42.22 
 
 
670 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 
404 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  39.45 
 
 
400 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  41.04 
 
 
403 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  42.96 
 
 
411 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.59 
 
 
456 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  38.37 
 
 
402 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
454 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  39.7 
 
 
400 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  42.07 
 
 
406 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 
400 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  37.78 
 
 
402 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  39.26 
 
 
657 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  37.68 
 
 
411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  41.87 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  37.75 
 
 
656 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  39.21 
 
 
412 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  39.26 
 
 
657 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.8 
 
 
409 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  40.3 
 
 
657 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  36.68 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  41.26 
 
 
408 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.9 
 
 
653 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  41.22 
 
 
671 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  37.29 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.31 
 
 
409 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  37.56 
 
 
409 aa  269  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  40.35 
 
 
407 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  39.08 
 
 
410 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  40.62 
 
 
409 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.8 
 
 
644 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
415 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  41.4 
 
 
391 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  39.71 
 
 
410 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  40 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39 
 
 
651 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  40.34 
 
 
409 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.15 
 
 
417 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
649 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  41.08 
 
 
405 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.61 
 
 
661 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  37.38 
 
 
410 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  36.39 
 
 
409 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  35.78 
 
 
650 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  38.31 
 
 
410 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  39.18 
 
 
412 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  38.06 
 
 
398 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  38.06 
 
 
410 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 
418 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  35.38 
 
 
647 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  41.98 
 
 
650 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  38.18 
 
 
647 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  37.32 
 
 
656 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.95 
 
 
642 aa  249  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.9 
 
 
405 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  37.32 
 
 
682 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  37.32 
 
 
667 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  37.32 
 
 
682 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.9 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 
405 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  37.56 
 
 
667 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 
405 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.32 
 
 
656 aa  245  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  36.82 
 
 
409 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  36.82 
 
 
409 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  35.88 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>