More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3269 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  73.92 
 
 
418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  60.62 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  58.91 
 
 
401 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  50.24 
 
 
410 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.11 
 
 
405 aa  309  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  43.47 
 
 
406 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  40.38 
 
 
406 aa  289  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  40.86 
 
 
406 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  41.98 
 
 
412 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  39.66 
 
 
406 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  41.47 
 
 
411 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 
406 aa  277  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  42.92 
 
 
410 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  40.44 
 
 
400 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  40.1 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  41.2 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  40.98 
 
 
410 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  42.41 
 
 
404 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43.86 
 
 
409 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  43.61 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  43.1 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.84 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  44.39 
 
 
409 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.62 
 
 
405 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  44.16 
 
 
409 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  43.93 
 
 
409 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  43.03 
 
 
408 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  42.41 
 
 
409 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  43.37 
 
 
405 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  39.06 
 
 
443 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  40.48 
 
 
401 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40 
 
 
658 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.47 
 
 
391 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  39.76 
 
 
402 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  44.12 
 
 
409 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.76 
 
 
407 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.84 
 
 
403 aa  249  8e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.82 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.24 
 
 
412 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  37.95 
 
 
401 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.53 
 
 
653 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  40.1 
 
 
406 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.28 
 
 
401 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.81 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.42 
 
 
403 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  37.59 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  39.27 
 
 
400 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.05 
 
 
644 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 
405 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 
405 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40.14 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  38.69 
 
 
405 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.56 
 
 
663 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  38.04 
 
 
401 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
401 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.21 
 
 
411 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  39.57 
 
 
403 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  38.52 
 
 
657 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  36.56 
 
 
404 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40.33 
 
 
671 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  39.08 
 
 
663 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  36.32 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.48 
 
 
715 aa  235  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  38.53 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.72 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.65 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
654 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.65 
 
 
670 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  38.32 
 
 
414 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.95 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  39.42 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 
392 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  39 
 
 
656 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  39.17 
 
 
657 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  39.1 
 
 
394 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.26 
 
 
409 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.13 
 
 
652 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  36.43 
 
 
657 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  38.19 
 
 
423 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  37.68 
 
 
405 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  37.68 
 
 
405 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.59 
 
 
409 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.89 
 
 
651 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.95 
 
 
402 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.95 
 
 
402 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  36.6 
 
 
402 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  35.44 
 
 
657 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  37.18 
 
 
397 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.47 
 
 
641 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  41.59 
 
 
650 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  37.77 
 
 
656 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  37.47 
 
 
409 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  36.28 
 
 
402 aa  222  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.01 
 
 
642 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  38.61 
 
 
654 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  35.44 
 
 
656 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  33.19 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>