More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0412 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  60.3 
 
 
398 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  59.39 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  58.23 
 
 
395 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  43.56 
 
 
409 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  42.36 
 
 
405 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  41.65 
 
 
409 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  41.83 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.38 
 
 
409 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  42.14 
 
 
407 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  43.34 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 
405 aa  268  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  40.54 
 
 
405 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  40.98 
 
 
405 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  40.55 
 
 
399 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  44.1 
 
 
414 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  40.73 
 
 
405 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  38.64 
 
 
394 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  40.35 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  38.9 
 
 
401 aa  259  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  37.81 
 
 
409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  37.81 
 
 
409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.51 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  36.36 
 
 
410 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  36.59 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  36.36 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.48 
 
 
443 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  36.21 
 
 
409 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  39.95 
 
 
644 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  41.23 
 
 
411 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  41.83 
 
 
415 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  41.94 
 
 
409 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  42.34 
 
 
414 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  39.2 
 
 
401 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  40.68 
 
 
410 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.45 
 
 
406 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  40.91 
 
 
653 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.34 
 
 
400 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  41.2 
 
 
420 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
409 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 
404 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  39.95 
 
 
409 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.92 
 
 
391 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.81 
 
 
651 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  37.53 
 
 
423 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 
654 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.23 
 
 
406 aa  236  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  42.07 
 
 
671 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  39.4 
 
 
657 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  36.63 
 
 
412 aa  235  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  40.25 
 
 
661 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.85 
 
 
403 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  40.24 
 
 
420 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  39.06 
 
 
418 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.68 
 
 
394 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  36.91 
 
 
392 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.79 
 
 
400 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  38.81 
 
 
657 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.42 
 
 
408 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 
409 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
403 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  38.35 
 
 
656 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  41.54 
 
 
656 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  37.91 
 
 
400 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  37.47 
 
 
402 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  41.48 
 
 
402 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  37.69 
 
 
678 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.69 
 
 
678 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.56 
 
 
663 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  41.54 
 
 
654 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  37.69 
 
 
678 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  40.2 
 
 
409 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  38.7 
 
 
412 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  39.45 
 
 
399 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  34.76 
 
 
397 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.05 
 
 
663 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  35.4 
 
 
403 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  39.21 
 
 
654 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
406 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  35.43 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.07 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  39.04 
 
 
648 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  39.04 
 
 
648 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.04 
 
 
652 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  42 
 
 
403 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  40.34 
 
 
410 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  41.46 
 
 
668 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  41.46 
 
 
668 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.06 
 
 
417 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.78 
 
 
456 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
403 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
649 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  36.48 
 
 
400 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>