More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0584 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  99.75 
 
 
404 aa  802    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  804    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  48.79 
 
 
402 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 
405 aa  265  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.56 
 
 
408 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  39.8 
 
 
409 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  36.97 
 
 
401 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 
401 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  39.07 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  39.66 
 
 
409 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  37.91 
 
 
406 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  40.34 
 
 
409 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  38.41 
 
 
406 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
409 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  36.43 
 
 
412 aa  239  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  36.43 
 
 
658 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  36.26 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  35.4 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 
406 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 
409 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.68 
 
 
653 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  35.07 
 
 
400 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.32 
 
 
406 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  35.7 
 
 
407 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  38.55 
 
 
657 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  38.67 
 
 
402 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  35.61 
 
 
405 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  37.75 
 
 
656 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  36.49 
 
 
409 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  36.49 
 
 
409 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  37.25 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.66 
 
 
408 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  36.49 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  34.79 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 
405 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.88 
 
 
409 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
409 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.69 
 
 
657 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  34.39 
 
 
644 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.9 
 
 
670 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  36.32 
 
 
417 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  34.47 
 
 
402 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  36.27 
 
 
657 aa  216  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  34.29 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  34.62 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.83 
 
 
663 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 
405 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.81 
 
 
663 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 
405 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.6 
 
 
648 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  35.48 
 
 
443 aa  212  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  35.38 
 
 
404 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 
410 aa  212  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.6 
 
 
648 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  33.99 
 
 
400 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.22 
 
 
652 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
397 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
403 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
402 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  35.11 
 
 
403 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  33.73 
 
 
402 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
401 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  35.06 
 
 
392 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.15 
 
 
651 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  34.29 
 
 
401 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.24 
 
 
394 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  35.59 
 
 
648 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  33.58 
 
 
652 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.44 
 
 
411 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  33.5 
 
 
647 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  33.33 
 
 
707 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  36.69 
 
 
423 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  34.3 
 
 
400 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  33.25 
 
 
394 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  34.47 
 
 
654 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  35.49 
 
 
409 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
398 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.56 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  32.05 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.33 
 
 
657 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
405 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.37 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 
400 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  32.76 
 
 
647 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  36.43 
 
 
406 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  35.1 
 
 
668 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.87 
 
 
403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  31.55 
 
 
666 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.89 
 
 
642 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  35.92 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.53 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.01 
 
 
409 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  33.33 
 
 
653 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  32 
 
 
412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  32.29 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>