More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2043 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  812    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  58.06 
 
 
401 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  57.07 
 
 
400 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  55.33 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  54.34 
 
 
400 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  52.61 
 
 
402 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  52.97 
 
 
403 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  49.21 
 
 
456 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  52.27 
 
 
400 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  52.02 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  50.89 
 
 
402 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  48.88 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  50.13 
 
 
400 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  48.88 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  48.65 
 
 
401 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  50.25 
 
 
403 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  49.14 
 
 
401 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  49.14 
 
 
401 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  49.38 
 
 
402 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  43.14 
 
 
406 aa  328  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  44.23 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.84 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  44.23 
 
 
409 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  44.47 
 
 
409 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  39.6 
 
 
406 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  42.82 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  38.25 
 
 
412 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.25 
 
 
408 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  41.15 
 
 
409 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  40.9 
 
 
409 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  43.32 
 
 
409 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 
405 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  40.54 
 
 
409 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  40.9 
 
 
409 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  38.38 
 
 
658 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  38.39 
 
 
405 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 
406 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 
406 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  40.91 
 
 
657 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.13 
 
 
656 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  39.14 
 
 
657 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  39.65 
 
 
404 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  39.16 
 
 
443 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  40.2 
 
 
670 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.06 
 
 
653 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.2 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  37.12 
 
 
657 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  37.07 
 
 
409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.71 
 
 
412 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  34.8 
 
 
411 aa  259  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  38.97 
 
 
406 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.18 
 
 
653 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.11 
 
 
408 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.94 
 
 
671 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  38.72 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  38 
 
 
707 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  36.4 
 
 
454 aa  250  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
410 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  38.71 
 
 
411 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.97 
 
 
394 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.25 
 
 
661 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  38.27 
 
 
405 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  37 
 
 
414 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  37.65 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.61 
 
 
644 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 
405 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  36.57 
 
 
407 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  36.54 
 
 
409 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
645 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
678 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  34.41 
 
 
678 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  34.41 
 
 
678 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  34.25 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  36.57 
 
 
405 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  36.57 
 
 
405 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  36.5 
 
 
405 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  37.93 
 
 
409 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 
654 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  36.48 
 
 
409 aa  235  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  35.15 
 
 
403 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.65 
 
 
651 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.09 
 
 
394 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.42 
 
 
647 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  34.24 
 
 
657 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  39.26 
 
 
650 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  35.16 
 
 
656 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  36.48 
 
 
409 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.59 
 
 
653 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  37 
 
 
414 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  36.48 
 
 
409 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.72 
 
 
648 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.83 
 
 
652 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.23 
 
 
647 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  36.6 
 
 
417 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  36.52 
 
 
654 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.84 
 
 
653 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  35.06 
 
 
681 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>